肝癌是危及人生命的常见病，早期诊断、及早治疗是延长寿命的重要手段。但由于肝脏隐匿在上腹深部，外有肋骨为其屏障，故肿大早期不易发现;另外，肝脏有强大的代偿能力，早期常无症状，这也给肝癌的早期诊断带来一定的困难。因此，对于肝癌的早期诊断，在无症状的人群中发现早期病例，可有效的降低肝癌的病死率。
肝癌在诊断时需注意以下疾病的鉴别：
1、继发性肝癌：继发性肝癌与原发性肝癌比较，继发性肝癌病情发展缓慢，症状较轻，其中以继发于胃癌的最多，其次为肺、结肠、胰腺、乳腺等的癌灶常转移至肝。常表现为多个结节型病灶，甲胎蛋白(AFP)检测除少数原发癌在消化的病例可阳性外，一般多为阴性。
2、肝硬化：肝癌多发生在肝硬化的基础上，两者鉴别常有困难。鉴别在于详细病史、体格检查联系实验室检查。肝硬化病情发展较慢有反复，肝功能损害较显著，血清甲胎蛋白(AFP)阳性多提示癌变。
3、活动性肝病：以下几点有助于肝癌与活动性肝病(急慢性肝炎)的鉴别。AFP甲胎球蛋白检查和SGPT谷丙转氨酶必须同时检测。
4、肝脓肿：表现发热、肝区疼痛、有炎症感染症状表现，白细胞数常升高，肝区叩击痛和触痛明显，左上腹肌紧张，周围胸腔壁常有水肿。
5、肝海绵状血管瘤：该病为肝内良性占位性病变，常因查体B型超声或核素扫描等偶然发现。该病我国多见。鉴别诊断主要依靠甲胎蛋白测定，B型超声及肝血管造影。
6、肝包虫病：患者有肝脏进行性肿大，质地坚硬和结节感、晚期肝脏大部分被破坏，临床表现极似原发性肝癌。