如果发生胚胎停育，母体会出现一系列的改变以利其排出体外。首先是雌孕激素下降，机体对胚胎产生免疫排斥的效应，母体和胚胎之间的血管形成血栓发生离段，在这过过程中可能导致阴道出血。此时的出血表现我们称之为先兆流产，是胚胎要排出体外的信号。这需要和胚胎正常发育过程中的阴道出血相鉴别，胚胎正常发育过程中如果因为局部血管破裂可以表现为阴道出血，此时的出血不会导致胚胎排出体外因此不能称之为先兆流产。
在胚胎排出的过程中会出现短暂的下腹疼痛。胚胎停育后早孕反应可以会减轻，但早孕反应本身就会因个体差异而不同，因此不能用早孕反应来判断胚胎发育的情况。大多数孕妇胎儿停止发育后无明显症状，需通过激素检查结合早孕期超声检测明确诊断。