除免疫接种外，还有其他一些措施可用来帮助人体的自然防御系统击溃传染病。细菌感染通常可被一种称作抗生素的药物征服。一些源于活体微生物的物质可杀死其他微生物。
例如，青霉素就是来自一种称作青霉菌的活体真菌。青霉素是最常用的抗生素之一，最常用的还有头孢菌素、四环素和红霉素。
上述每种抗生素在治疗特定疾病方面都很有效。抗生素的药理是消灭细菌或防止它们繁殖。磺胺类药物属合成的抗生素药物，在治疗感染方面也很有效。此类药物通常用于治疗尿路局部感染。
遗憾的是，这些药物无法攻击病毒。由于尚未研制出普遍有效的治疗药物，因此病毒是现在许多严重或致命传染病的病因。艾滋病(AIDS，获得性免疫缺损综合征)的致病病毒就属于无药可治且无预防疫苗的病毒。
研究人员一直在不断地探寻能帮助人体抗击传染病的新方法。医学在治疗这些疾病方面已取得了十分显著的进步。
还有一些传染病在以前根本无法控制，因而形成了一种无法消除的危险，而那个时候距现在也并不久远。许多传染病现在已经得到了控制，这是医学上取得的最大成就之一。