感染性腹泻病原微生物主要有志贺菌、沙门菌、空肠弯曲杆菌等。病毒及细菌毒素引起的腹泻一般不需用抗菌药物;对腹泻患者要留取粪便做常规检查与便菌培养，在未获取药敏实验结果前结合病情经验用抗菌药物。腹泻次数和粪便量较多者应及时补充液体和电解质;病情严重者应静脉给液，病情好转后改为口服，治疗原则：纠正水和电解质紊乱、继续饮食、合理用药。
常见治疗方式有以下几种
一、饮食治疗
急性感染性腹泻患者一般不需禁食(严重呕吐除外)，口服补液疗法或静脉补液开始后4h应恢复进食，少吃多餐(建议每日6餐)，进食少油腻、易消化、富含微量元素和维生素的食物，尽可能增加热量摄入。避免进食罐装果汁等，以免加重腹泻。
二、补液治疗
成人急性感染性腹泻患者，应尽可能鼓励其接受口服补液盐治疗，但有下述情况应采取静脉补液治疗。
(1)频繁呕吐，不能进食或饮水者。
(2)高热等全身状况严重，尤其是伴意识障碍者。
(3)严重脱水，循环衰竭伴严重电解质紊乱和酸碱失衡者。
(4)其他不适合口服补液治疗的情况。脱水引起休克者的补液应遵循“先快后慢、先盐后糖、先晶体后胶体、见尿补钾”的原则。
三、止泻治疗
(1)肠黏膜保护剂和吸附剂蒙脱石、果胶和活性炭等，有吸附肠道毒素和保护肠黏膜的作用。
(2)益生菌不仅对人体健康有益，还可以用于治疗腹泻病，能有效减少AAD的发生，能显著降低艰难梭菌感染。益生菌尽可能避免与抗菌药物同时使用。
四、抑制肠道分泌
(1)次水杨酸铋，抑制肠道分泌，减轻腹泻患者的腹泻、恶心、腹痛等症状。
(2)脑啡肽酶抑制剂，减少肠道水和电解质的过度分泌。
五、肠动力抑制剂
洛哌丁胺、苯乙哌啶。感染性腹泻不推荐使用。
六、病原治疗
抗菌药物的选择应用抗菌药物前应首先行粪便细菌培养和药敏，若无结果，则行经验性抗菌治疗。喹诺酮类药物为首选抗菌药物，复方磺胺甲恶唑为次选。鉴于细菌对喹诺酮类耐药情况越来越严重，对于严重感染者，以及免疫功能低下者的腹泻，在获得细菌培养结果并对大环内酯类类敏感的患者，可以考虑使阿奇霉素。如48h后病情未见好转，则考虑更换其他抗菌药物。利福昔明是一种广谱、不被肠道吸收的抗菌药物，亦可选用。CDI的治疗甲硝唑是轻中型CDI治疗的首选药物，对于重型CDI，或甲硝唑治疗5～7天失败的患者应改为万古霉素治疗。
温馨提示
病毒性腹泻的病原学治疗一般不用抗病毒药物和抗菌药物。硝唑尼特对病毒性腹泻有一定治疗作用。急性寄生虫感染性腹泻的治疗使用替硝唑或甲硝唑，急性溶组织内阿米巴肠病，使用甲硝唑或替硝唑，随后加用巴龙霉素或二氯尼特。隐孢子虫病，使用螺旋霉素。