龟头炎是由很多的原由导致的，不一样的原由导致的表现不一样，所以患者的症状也就各不相同，以下是包皮龟头炎的鉴别与诊断方法：
一、包皮龟头炎与类似疾病鉴别：
1、阴部疱疹
又称生殖器疱疹，是性病的一种，疱疹亦可发生于龟头及包皮内侧，为簇集性小水疱，灼热疼痛，很快破溃形成溃疡，易复发。
2、软下疳
软下疳为性传播疾病的一种。病人有不洁性交史，多于包皮、冠状沟、龟头及系带两侧出现红色炎性丘疹，迅速变成水疱或脓疱，伴剧痛，破溃后形成溃疡，呈圆形或椭圆形，底部覆以秽浊脓液，恶臭。革兰染色涂片检查，可发现杜克雷嗜血杆菌。
3、硬下疳
硬下疳为一期梅毒的主要表现。病人有不洁性交史，于包皮内侧或边缘、龟头、阴茎冠状沟等处可见单发皮损，为一红色丘疹，绿豆至黄豆大小，质硬，局部无疼痛及瘙痒感，继而糜烂、溃疡，溃疡底部清洁，分泌物少，无臭味。梅毒血清反应阳性。
4、阴茎癌
阴茎癌好发于中年以上，也与包茎或包皮过长密切相关，最常发生于龟头、包皮内板及冠状沟处。初起为丘疹、溃疡或呈疣状，晚期则因瘤体增大破溃而呈菜花状，甚至糜烂、出血，分泌物恶臭。组织病理学检查可发现癌细胞，血清癌胚抗原阳性。
5、淋病
也可发生龟头包皮炎症，出现龟头糜烂、包皮水肿等，易与本病混淆。但淋病患者多有不洁性交史，临床上以急性化脓性尿道炎症状为主，表现为尿道涩痛、排尿不畅及尿道口有脓性分泌物。分泌物涂片可查到革兰阴性双球菌。
二、诊断包皮龟头炎的方法：
1、直接镜检
刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。将待检标本用一定浓度的氢氧化钾或生理盐水制片，镜下可见成群的卵园形孢子和假菌丝，若是找到较多的假菌丝时，说明念珠菌处于致病阶段。
2、染色检查
也可用革兰染色法，刚果红染色或PAS染色法染色后镜检，其阳性率均比直接镜检法高。革兰染色，孢子和假菌丝染成兰色，刚果红和PAS染色，孢子和假菌丝则染成红色。
3、念珠菌培养
涂片检查阴性的患者，可进行念珠菌培养。在无菌条件下将受检标本接种于沙氏培养基上，一般情况下多采用试管法培养。接种时将试管培养基斜而割破少许，每管接种2到3处，每份标本接种2管。将培养基放入37℃温箱内孵育24至48小时后观察，可见大量乳白色菌落生长，用接种针挑取少量菌落涂片，直接镜检或染色后镜检，可见大量芽孢子，可初步诊断为念珠菌感染。
4、念珠菌抗体检查
用免疫双扩法或胶乳凝法可检出白色念珠菌抗体。