做好预防工作是防治肠结核的根本办法。并着重对肠外结核的发现，特别是肺结核的早期诊断与积极的肠结核治疗，尽快使痰菌转阴，以免吞入含菌的痰而造成肠感染。必须强调有关肠结核的卫生宣传教育。
此外，加强卫生管理，禁止随地吐痰，讲究饮食卫生，提高全民预防肠结核意识对其预防有一定意义。
1) 休息与营养
休息与营养可加强患者的抵抗力，是治疗的基础。活动性肠结核须卧床休息，积极改善营养，对消瘦、营养不良和因胃肠症状而妨碍进食者，宜予以静脉内高营养治疗。
2) 肠结核治疗
应做到早期、联合、适量、规律和全程用药。
3) 对症治疗
腹痛可用颠茄、阿托品和其他抗胆碱能yao物。摄入不足或腹泻严重者，应补充液体与钾盐，防止水、电解质与酸碱失衡。
对不完全性肠梗阻的患者，不仅要按上述对症治疗外，还需配合胃肠减压，以缓解梗阻近段肠区的膨胀与潴留。
4) 手术治疗
适用于完全性肠梗阻、急性或慢性肠穿孔引起的粪瘘以及肠道大出血等内科治疗无效者。此外，对增生型结核也可考虑部分手术治疗。
本病的预后取决于能否早期诊断治疗。肠结核早期病变是可逆的，经适当治疗可完全痊愈。