衣原体过去曾归属立克次体，现分出成为独立一属。衣原体寄生于宿主细胞内，但不同于病毒，它具有细胞壁，含有DNA和RNA。CT是6个月以下小婴儿肺炎的主要病原之一，多由受感染的母亲通过产道分娩而传染。
肺炎衣原体是20世纪80年代中期发现的一种新的衣原体生物种，是严格的人类病原体，不存在动物中间宿主，主要引起人类急性呼吸道感染，尤以肺炎多见，是5岁以上小儿及成人肺炎的病原之一。鹦鹉热衣原体主要寄生于鹦鹉及其禽类和低等哺乳动物体内，人通过与禽类接触或吸入鸟粪或被分泌物污染的羽毛而得病，罕见有人与人之间传播。
一、衣原体肺炎的病因：
衣原体肺炎的病因为肺炎衣原体感染，是新发现的一种衣原体主要引起呼吸道和肺部感染。1986年Grayeton等在学生急性呼吸道感染中，发现一种衣原体，以后于成人呼吸道疾病中亦被发现，当时命名为鹦鹉热衣原体TWAR-TW株，后经研究证明该衣原体为一新种并定名为肺炎衣原体。
二、沙眼衣原体的感染途径：
①胎儿通过母亲产道时直接感染;
②眼部感染衣原体后通过鼻泪管侵入呼吸道。
三、鹦鹉热衣原体肺炎的病因和发病机制
(一)病因
衣原体肺炎是由衣原体引起的肺炎，衣原体分为沙眼衣原体(CT)、肺炎衣原体(CP)鹦鹉热衣原体和家蓄衣原体。
鹦鹉热衣原体侵入呼吸道后经血侵入肝、脾等网状内皮细胞。在单核、吞噬细胞内繁殖后，由血行播散到肺及其他器官，在肺内引起小叶性或间质性肺炎、细支气管炎和支气管上皮细胞脱屑和坏死。病变部位可产生实变和少量出血，肺间质有淋巴细胞浸润，肺门淋巴结可肿大。肝脏可出现局部坏死，脾常肿大，心、肾、神经系统、消化系统等均可受累。
病源为鹦鹉热衣原体，鹦鹉为主要传染源。本病可通过呼吸道传染也可通过飞沫直接传播或通过排泄物污染尘埃而间接传染。
(二)发病机制
受鹦鹉热衣原体感染的鸟类通常累及肠道，病原体经粪便排出体外。鹦鹉热衣原体对外界的抵抗力很强，在干燥的鸟粪中可存活数月。鸟-人的感染方式是气溶胶呼吸道吸入。有报道鹦鹉热衣原体存在人-人传播途径，但罕见。鹦鹉热衣原体经呼吸道吸入体内后首先进入肝和脾的网状内皮细胞增殖，再经血液进入肺和其他器官，所以人类的鹦鹉热既可以是呼吸道感染，也可能是以呼吸系统为主的全身性感染。