1、潜伏期
尚未有准确报道。目前估计在7天以内，一般为1-3天。
2、临床症状
临床症状急性起病，早期表现类似普通型流感，主要为发热，体温大多持续在39℃以上，热程1～7天，一般为3～4天，可伴有流涕，鼻塞，咳嗽，咽痛，头痛和全身不适，部分患者可有恶心，腹痛，腹泻，稀水样便等消化道症状，多数轻症病例预后良好。重症患者病情发展迅速，可出现肺炎，急性呼吸窘迫综合征，肺出血，胸腔积液，全血细胞减少，肾功能衰竭，败血症，休克及Reye综合征等多种并发症，严重者可致死亡。治疗中若体温持续超过39℃，需警惕重症倾向。感染者症状较轻，大多数患者可出现眼结膜炎，少数患者伴有温和的流感样症状。H9N2感染者仅引起一过性的流感症状，尚无死亡病例报道。
3、体征
重症患者可有肺部实变体征等。
4、并发症
多数轻症病例预后良好，且不留后遗症。某些病例病情发展迅速，出现重症肺炎、急性呼吸窘迫综合征、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、多脏器功能衰竭、败血症、休克及Reye综合征等多种并发症，可导致死亡。