病损表现为灰白色角化小丘疹，为针头大小，组成细的花纹，称WickhamStriae。表面光滑可互相交织延伸成条纹状、网状、环状、斑块状等多种形态，周围炎症不明显，可有红色边缘，粘膜可发生红斑、充血、糜烂、溃疡、萎缩和水疱等损害。
口腔内可同时出现多样损害，病损可互相重叠和互相转变，如网状病损在吸烟等刺激因素下，可转变为斑块状病损，萎缩型转为糜烂型，环网状病损时间长久可变成不规则形状的棕褐色或暗紫色色素沉着。病损多呈对称性分布，粘膜一般保持原有的柔软度和弹性。病情可有反复波动，轻重不等，一般难以自愈。
根据解剖部位病损划分
1、颊扁平苔藓
颊为口腔扁平苔藓最常见的发病部位，一般认为可达80%～90%。Andreason统计115例扁平苔藓中，114例颊部有扁平苔藓损害，单侧颊部损害只有6例。颊部病损以磨牙前庭沟为好发区域，可沿前庭沟向前蔓延至口角，向后波及磨牙后垫翼下颌韧带区域，甚至波及整个颊部粘膜。病损形态多样，以网状灰白条纹最多见，也可有树枝状、线条状、环状、丘疹、斑块、结节等不同类型损害。在颊咬合线区常表现为索条状、斑点、线状或网状损害。颊部斑点损害应与皮脂腺移位区分。颊部损害多为双侧对称发生，单侧发生损害较少。
2、舌扁平苔藓
一般认为发生率仅次于颊部，有报告统计为44%。病变多发生在舌前2/3区域，包括舌尖、舌缘和舌腹部。损害多样，一般较限局，界限清楚。舌背早期损害多为丘疹斑点状，灰白透蓝，开始时侵及丝状乳头顶部，而乳头下半部粘膜正常，以后整个乳头受累。由白色丘疹组成环网状损害，从中央逐渐向周围及深层扩展。并形成圆形或椭圆形灰白斑块损害，触之稍粗糙。舌乳头由萎缩逐渐光秃，向周围扩展，形成中央上皮萎缩变薄，呈鲜红或暗红平滑斑，在此基础上可发生糜烂，糜烂面愈合后，舌乳头恢复则非常缓慢。舌背病损也有呈现乳头增殖角化和部分萎缩混合病损。病损可为孤立存在，也可呈不规则形状散在分布。舌腹部病损多呈网状、树枝状，或呈线条纹，单侧或左右对称发生。发生于舌尖及口底部的扁平苔藓较少见，可侵犯舌系带，并向前发展至下颌骨舌侧部分。舌背扁平苔藓如角化增殖明显，有时不易与白斑区别。舌侧缘舌腹部扁平苔藓病损如长期充血红斑，有斑点状增生突起、糜烂溃疡者，应注意观察或及时进行活体组织检查。
3、唇扁平苔藓
Perry统计唇部损害占整个口腔扁平苔藓的20.4%，Simpson统计占80%，下唇受损多于上唇。Andreason统计下唇占20.9%，而上唇仅占2.6%。唇红部损害多见呈网状或环状、线条纹状，可以伸向口角。伴有枇糠状鳞屑，白纹多模糊不清，舐湿或用水涂擦则透明度增加，线纹清晰度增高。因唇红粘膜乳头层接近上皮表浅部分，所以固有层炎症水肿时，可发生水疱而导致糜烂渗出形成结痂。唇部陈旧性损害，沿皮肤侧边缘处，可出现带状色素沉着斑。
4、龈扁平苔藓
龈部扁平苔藓发病较颊、唇、舌部位为少。HuynhVanChan统计为11.7%，而Preey统计为4%。在附着龈可见灰白色斑纹，因上皮萎缩而可见充血红斑水肿，甚至上皮剥脱发生糜烂，很易与剥脱性龈炎混淆。可有灼热敏感症状。如合并颊部或其他部位扁平苔藓时，则比较易于诊断。如只单独有牙龈损害，则应仔细观察，有无细微灰白网纹。必要时则需借助病理组织检查，以明确诊断。
5、腭扁平苔藓
是口腔较少受侵的部位，一般认为小于8%。病损常由前庭沟，龈颊皱襞或缺牙齿槽嵴处蔓延而来。在硬腭常位于腭侧龈缘附近，呈狭长条索状，中央萎缩发红，可伴有糜烂，边缘色白微隆起，亦可沿硬腭边缘呈带状分布。软腭损害较硬腭少见。呈灰白色网状花纹，可局限一处，亦可遍及整个上腭，偶有萎缩红斑或小水疱，糜烂则较少见。
6、口腔粘膜扁
平苔藓可在口腔粘膜多个部位出现各种类型的损害，也可在同一部位出现多种损害，病损形态可各不相同。因此一个部位一种病损常不能代表整个口腔疾病状况，故国内外许多学者基于临床实际，把口腔扁平苔藓分为两型，即糜烂型和非糜烂型。各种类型斑纹损害均属于非糜烂型，可伴有轻度充血，表面稍粗糙，但无明显自觉症状。糜烂型则表现为上皮明显充血水肿，剥脱糜烂，有假膜覆盖，多有自发痛，遇刺激物敏感、灼痛加重，口内可同时伴有非糜烂型损害。