肝移植远期出现黄疸升高，可能的原因是多方面的，以下是依据可能性递减排列。
1、急性排异,主要是自身免疫力提高，排异药物减少等原因引发。诊断依据主要可行肝穿刺病理诊断，也可通过IMMUKNOW检测作辅助依据。
2、长期服用抗排异等药物引起的药物性肝损，诊断依据可行肝穿刺病理检查，但很能出现典型表现，通常通过更换药物诊断性治疗来倒推诊断。
3、非特异性病毒感染，如CMV、EBV、HSV等，相关病毒抗体检测和病理判断。
4、乙肝或丙肝病毒复发。
5、原发性疾病复发，如PBC/PSC，自身免疫性肝炎。
6、慢性排斥，各种原因集中到后期病理上发现胆管上皮减少或消失的现象。
7、外科原因，供血不足或胆管狭窄。