有人就说了这个小儿和新生儿怎么可能会发生这个由感染引起的疾病呢?但是事实上就是存在着的，多是因为一些先天的因素，再加上后天的照顾不周，引起的炎症，就是炎症造成
(1)小儿骶骨曲尚未形成，肛门内括约肌紧张度较弱，粪便易直接压迫肛管处齿线，肛窦粘膜擦破，易使细菌侵入致病。这个细菌进入以后，因为环境比较潮湿，容易促使细菌的不断的繁殖，就会逐渐的发展，孩子也不会说，时间长了就形成了肛瘘。
(2)小儿常因尿布皮炎，刺激肛门周围皮肤，形成肛门周围皮下脓肿与肛窦相通，而成肛瘘。这种情况也是很多的，有些家长比较粗心，孩子发炎了，也不知道，看见了，也不会计算的处置，就引起了炎症。
(3)新生儿皮脂腺分泌亢进，感染形成肛周皮下脓肿与肛窦相通，而致肛瘘。
(4)新生儿生理性免疫机能不全，易发生肛门感染，形成肛瘘。