内分泌失调不孕是指内分泌失调而导致的女性不孕，其实正常排卵周期的建立需下丘脑—垂体—卵巢轴功能正常。其中任何一个部位功能障碍都可能导致不排卵，因而引起无月经、月经稀发、功血等，进行可能导致不孕症，由这种内分泌原因导致的不孕症即内分泌失调性不孕。
医学解释，体内有内分泌系统，分泌各种激素和神经系统一起调节人体的代谢和生理功能。正常情况下各种激素是保持平衡的，如因某种原因使这种平衡打破了(某种激素过多或过少)这就造成内分泌失调，会引起相应的临床表现。而内分泌失调是导致不孕症的重要原因。
内分泌失调与情绪因素使女性下丘脑-垂体-卵巢性腺轴激素分泌过多或过少;新陈代谢功能紊乱等有关;以至于出现以下疾病造成不孕：排卵障碍、闭经、多囊卵巢综合症、多毛症与男性化、高催乳血症、黄体功能不全、功能性子宫出血、排卵期出血、卵巢功能不全、卵巢早衰等。其中排卵障碍比较常见，也是由于妇科疾病造成的。