尿道炎在治疗上除了要按时吃药外，还要对性伴侣同时进行治疗，并减少并发症的发生，避免耐药的出现。下面几项简单说明一下尿道炎的用药注意。
1、要按时按量用药
因为非淋菌性尿道炎的治疗不同于淋病能做到短期足量治疗，而且服药次数多，持续时间长，患者容易因公因事而忘记服药，或者1~2天后基本消失而停服，影响疗效或复发。此时不要急于改换药物。
2、性伴侣要同时进行治疗
病人的症状持续存在，或症状消失后又复发，最可能的原因是性伴侣未经治疗。未经治愈与性伴侣性交，病菌由未经治疗的性伴侣再次传给患者。
3、对于炎症明显者可予以经验性治疗
例如：氧氟沙星加甲硝唑;或者是头孢曲松加甲硝唑加阿奇霉素等，疗程可适当延长。如尿道炎症不明显，可予抗组胺药，或者是尿道平滑肌解痉剂，或中药调理。
4、如果患者症状反复发作还应警惕并发症的出现
常见的并发症如前列腺炎等，应做好相应的细菌学检查并及时治疗。若为滴虫、霉菌或其他少见病，尤其是霉菌性尿道炎，不能一味加用素，否则对患者危害更大，应查清后对症治疗。
5、避免耐药
已有不少报告分解尿素支原体对四环素有耐药性，若疑属于这种情况，则及时用其他抗生素。