1、保守性手术
保守性治疗一般是用于年轻和有生育要求的女性身上。保留女性朋友的子宫和附件，只是进行切除病灶和分离已有的粘连，重建女性的卵巢，进行修复组织。但是有一定的复发几率。
2、半根治手术
女性如果没有生育要求，其病灶比较严重的情况，年龄是小于45岁的女性，一般进行行子宫和病灶的全切，但要尽可能的保留女性一侧正常的卵巢组织，避免导致女性过早出现闭经现象，通常情况下，半根治术后的复发率低，后遗症也比较少，但是对有生育要求的女性不合适。
3、根治性手术
对于年龄已经接近绝经期，而且病情比较重，出现过复发的女性，可以进行全子宫和双侧附件进行切除。手术时，应该尽可能的避免女性朋友的卵巢内膜囊肿发生破裂。
4、微创手术
目前，采用腔镜微创手术治疗子宫内膜异位症，效果比较好，对女性伤害小，术后恢复快。