非淋菌性尿道炎是由性接触传染的一种尿道炎，但在尿道分泌物中查不到淋球菌。女性还有子宫颈炎等生殖道的炎症。病原体多为衣原体，支原体、滴虫、疱疹病毒、念球菌、而衣原体、支原体的感染占80%以上。尿道炎可分为两类，淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。前者是指淋病双球菌致成的尿道炎，也秒为特异性尿道炎。而后者则指的是淋病双球菌以外的其它微生物所致的尿道炎，也称为非特异性尿道炎。这类尿道炎中，已知其病原体的，则称为真菌性尿道炎和滴虫性尿道炎等，而不再包括在非淋菌性或非特异性尿道炎之内。目前，通常被称为非淋菌性尿道炎的是指衣原体(占40%-50%)、支原体(占20%-30%)及一些尚不明致病病原体的尿道炎。
非淋菌性尿道炎虽然症状较淋病轻，但危害并不比淋病轻。由于症状较轻，很多患者失去了治疗的最佳时期，从而使治疗非常困难，本病尤其在女性中症状极其轻微，而女性感染者由于症状轻微往往不予治疗，增加了本病传播的机会。本病除引起尿道炎外，在女性约一半以上的患者有合并症，如：急慢性输卵管炎、异位妊娠、不育、流产、死胎。而男性则会引起：附睾炎、前列腺炎、精囊炎、性功能障碍。