1.免疫因素，约占20%，在血中可以检出卵巢抗体，这类患者常常合并其他自身免疫性疾病如红斑狼疮，类风湿关节炎，先天性体中缺乏一种酶。
2. 细胞遗传学因素，先天性生殖细胞数少，卵泡闭锁加速，X染色体异常，10%患者有家族史。
3.物理因素，如手术，化疗，感染等导致促性腺激素分泌缺陷或促性腺激素受体或受体后缺陷。
4. 特发性卵巢早衰，患者无明确原因，染色体正常，性激素测定血FSH(卵泡刺激素)，LH(黄体生成素)升高，E2(雌激素)低下，PRL(泌乳素)正常，患者不仅雌激素缺乏，还有潜在的卵巢雄激素分泌不足，或肾上腺产生甾体激素能力轻度缺陷，腹腔镜检查多见小卵巢或萎缩性卵巢。