口腔扁平苔藓的病因是多方面的，精神上的一般是最重要的。压力过大或者病毒或细菌感染、遗传、慢性肝炎、胃溃疡很多疾病相关，有时候是一种疾病间相互影响的作用引起。口腔扁平苔藓的病因是多种多样的导致内分泌紊乱，五脏六腑功能失调而发病。以上只是口腔扁平苔藓患者在临床中遇到的一部分情况。但是也不排除其他因素，比如有的长期患各种慢性病，使身体衰弱而发病;有的镶金属义齿不适、或牙齿某处过于锋利，长期不良剌激而发病;有的长期吸烟剌激也是发病的一个原因。以下是具体因素。
1、内分泌因素
流行病学调查发现，中年女性OLP发病率较高。研究表明医学教|育网搜集整理，女性OLP患者月经期及绝经期血浆雌二醇(E2)及睾酮(T)含量低于对照组，而男性患者血浆中E2下降。同时在OLP组织切片中雌激素受体(ER)表达显着低于对照组。一些女性OLP患者在妊娠期间病情缓解，哺乳期过后月经恢复时，病损复发。
2、免疫因素
病理检查可见OLP上皮固有层内有大量淋巴细胞呈密集带状浸润是其典型病理表现之一，因而考虑0LP与免疫因素有关。
3、遗传因素
曾在一个家庭中发现有数人发病;有些患者有家族史。有的学者发现OLP的HLA抗原的A3、B5、B8位点有异常，频度增高。
4、心理因素
OLP的发生、发展与身心因素有密切关系。50%左右的0LP患者有精神创伤史(如下岗失业、亲属亡故、婚恋纠纷)，或生活压力过大，又不善于与人沟通，无法释放情绪等导致心情不畅、焦虑的因素。
5、感染因素
可能足致病因素之一，Lipschutz曾发现病损内有包涵体存在并认为是病毒感染的证据。但有些学者在实验中未得到任何病毒感染的证据。国内有学者提出0LP发病与幽门螺杆菌(HP)感染有关，并有抗HP治疗后有效的报告。
6、微循环障碍因素
对OLP患者及正常人的唇、舌黏膜、甲皱、舌菌状乳头医学教|育网搜集整理、眼球结膜等血管微循环的观察发现，OLP患者微血管形态改变明显，其扩张、淤血者显着高于正常组;其微血管血流的流速亦较正常组明显减慢。
该病属中医“口蕈”范畴。中医认为该病属于阴血不足，虚损积热化火，血虚生风产燥，致使肌肤粘膜失其濡养;或因思虑伤脾，脾失健运，湿热瘀滞蕴热化火;或为肝郁气滞蕴热化火;或肝肾阴虚，阴虚火旺，虚火上炎所致。另外加以风、湿、热三邪蕴于肌肤不得疏泄，可诱发加重该病。