随着现代医学诊断技术的发展，总结出激素类药物治疗和营养性药物治疗不孕不育的方法，在临床上也收到了较好疗效。药物治疗不孕不育很适合非器质性损伤造成的不孕不育。
1.激素类药物治疗
选择少精症或精液质量差的病例为治疗对象。
(1)绒毛膜促性腺激素(HCG)
目前临床应用的制剂包含有促间质细胞激素(ICSH)和促卵泡激素(FSH)。它刺激睾丸曲细精管产生精子刺激间质细胞发育释放睾丸酮，应用于垂体功能减退、FSH水平低下、继发性睾丸生精功能障碍者。剂量为1000u，隔日肌肉注射1次，10～12周为一疗程。
(2)氯菧酚胺
是一种合成的女性激素衍生物，在下丘脑竞争性地与雌二醇受体结合，抑制雌二醇对下丘脑的反馈作用，促使GnRH和垂体促性腺激素分泌而有利于精子发生，使用方法为每日～50mg口服25天停5天，持续3～6个月。
(3)睾丸酮
小剂量睾丸酮具有直接刺激生精上皮细胞，促进精子发生和提高精子活力的作用;大剂量睾丸酮反而抑制生精作用，不过一旦停药则在半年左右出现反跳现象，导致促性腺激素升高和精子计数超过治疗前水平，并持续数月之久。
具体用法为小剂量睾丸酮治疗
甲基睾丸素10～15mg/d，或1-甲氢睾酮(mesterolone)50mg/天，或Flucrometerone50mg/d。大剂量睾丸酮治疗可用丙酸睾丸酮50mg每周3次肌注，12周为一疗程。或庚酸睾酮，每3周200mg，肌注，9周为一疗程。
2.营养性药物治疗
疗效不确切，下列药物对病因不明的不育症可能有益。
(1)足够的蛋白质和维生素A、B和E。
(2)谷氨酸(glutamicacid)0.6～2g，口服，每天3次，2～3个月为一疗程;或精氨酸(arginine)2～4g/d口服。
(3)补充某些微量元素，如给以锌制剂可能有好处。