1、局部治疗
口腔溃疡可局部涂含肾上腺皮质激素糊膏，假性毛囊炎和生殖器局部溃疡，局部涂抗生素软膏，眼炎急性发作时用散瞳剂及0.25%～1%可的松滴眼，炎症严重时，球结膜下注射地塞米松5mg1～2次，可减轻炎症渗透出，一般不主张用抗菌素。除非结膜和巩膜受累，此时用抗生素控制感染是必要的。
2、全身药物治疗
⑴白细胞功能抑制剂
代表药物为秋水仙碱，具有抗中性粒细胞趋化作用，也有一定的免疫调节作用。对关节炎，口腔溃疡及眼色素膜炎有效，常用剂量为0.5mg，一日二次。
⑵肾上腺皮质激素类
控制急性症状有效，但减量或停药后易复发，常用于重症患者，往往需要与免疫抑制剂或秋水仙碱联合用药。一般口服强的松 30～60mg/日。对于严重眼炎，中枢神经系统病变及严重血管炎患者可用甲基强的松龙1g/日，三天静脉冲击。同时酌情加用免疫抑制剂治疗。
⑶免疫抑制剂
主要用于眼炎，严重血管炎及主要脏器受累者。如环磷酰胺口服，每日2～3mg/kg或每月1g静脉滴注冲击。环孢素A，一般剂量每日3～5mg/kg。此外，还有苯丁酸氨芥、甲氨喋呤、雷公藤等。
⑷非甾体类抗炎药
有抗炎、镇痛及退热作用，对发热、关节炎、结节红斑有较好的疗效。
⑸抗凝剂
对有血栓形成或大、中动静脉血管炎者，可予阿斯匹林、双嘧达莫等抗凝剂或予尿激酶、链激酶等溶栓治疗。
⑹其他
如果患者有结核病或有结核病史，上述治疗效果不满意，可给于抗结核治疗，三联药物治疗至少观察半年。
3、手术治疗
肠道白塞病并发肠穿孔，肠瘘时需外科手术治疗，由于溃疡跳跃分布，手术切除可能不完全，术后有复发可能，还应继续加强内科治疗。平安医院自制特色中药、激光疗法等效果明显!