蛋白尿是比较早的多囊肾的症状表现之一，这和多囊肾患者的肾小球的屏障功能有关系，血尿是多囊肾病人发现自身患有多囊肾检查的主要因素。而大部分多囊肾病人会经历一个由轻转重的贫血过程，并且会常伴有夜尿。此多囊肾的症状一般和肾脏分泌的红细胞生成素递减、肾脏功能下降有关。另外。由于多囊肾挤压肾脏，高血压是多囊肾中出现频率较多的多囊肾的症状之一，一般在肾功能减退之前就有发生，且伴随头痛、头晕，与肾素一血管紧张素系统的亢进关系密切。
多囊肾患者容易有腰腹部适的症状，这比较好理解，是因为多囊肾患者的肾脏，因为囊肿增大到一定程度时，可以在单侧或是双侧上腹部摸到大小不一的肿块，并且会随着呼吸而移动，合并感染时伴有压痛。这时候的患者，会有腰背部压迫感，有时疼痛剧烈。可表现为间歇性或是持续性发作，有时可表现为腹痛，疼痛向上腹、腹股沟、背、胸部放射，疼痛可因跑步、久坐、活动而加剧。