慢性胰腺炎的病程常超过数年，临床表现为无症状期与症状轻重不等的发作期的交替出现，也可无明显症状而发展为胰腺功能不全的表现。典型病例可出现五联征：腹痛、胰腺钙化、胰腺假性囊肿、脂肪泻及糖尿病。轻重不等，可无明显临床症状，亦可以有明显的多种临床表现。具体症状如下：
1、腹痛
多至90%的患者存在程度不同的腹痛，间隔数月或数年发作一次，为持续性疼痛，多位于中上腹部，为钝痛或隐痛，亦可偏左或偏右，常放射到背部，疼痛部位与炎症部位一致，根据实验，用电刺激胰头部，疼痛发生在右上腹，刺激胰尾部，疼痛在左上腹，除向背部放射外，少数向下胸部，肾区及睾丸放散，横膈受累，可有肩部放射性疼痛，疼痛为持续性，深在，轻者只有压重感或灼热感，少有痉挛样感觉，饮酒，高脂，高蛋白饮食可诱发症状，疼痛严重时伴恶心，呕吐，这类患者的腹痛常有体位的特点，患者喜蜷曲卧位，坐位或前倾位，平卧位或直立时腹痛加重。
2、腹泻
轻症病人无腹泻症状，但重症病人腺泡破坏过多，分泌减少，即出现症状，表现为腹胀与腹泻，每天大便3～4次，量多，色淡，表面有光泽和气泡，恶臭，多呈酸性反应，由于脂肪的消化，吸收障碍，粪便中的脂肪量增加，此外，粪便中尚有不消化的肌肉纤维，由于大量脂肪和蛋白质丢失，病人出现消瘦，无力和营养不良等表现。
3、糖尿病
常见于病情反复发作数年之后，症状与普通糖尿病相似，病情一般较轻。对胰岛素高度敏感，易发生低血糖。
4、脂肪泻
是疾病发展到胰腺外分泌减少所致，临床上表现出脂肪及蛋白质消化吸收障碍。由于大量脂肪和蛋白质丢失(蛋白分解酶缺乏)，患者可出现消瘦、无力和营养不良等表现。脂肪泻的特征是粪便不成形，有油光并且恶臭，可见油滴浮在水面，镜检可见脂肪球。
5、体重下降
多因素综合作用的结果，长期反复的腹痛，进食后可诱发或加重腹痛的发作，故患者常限制饮食;胰腺外分泌功能损害，影响蛋白质和脂肪的消化与吸收;内分泌功能低下，并发糖尿病，导致葡萄糖代谢障碍;维生素摄入不足，影响了机体的正常代谢。病程越长，病情越重，体重下降越明显。
6、囊肿形成
因导管内蛋白质沉积或结石形成导致胰腺导管梗阻，胰液排泄不畅，以致形成大小不等的囊肿。
7、胰腺癌
约3%左右的患者合并胰腺癌，其原因还不清楚。
8、黄疸
黄疸一般为轻到中度，常以直接胆红素升高为主，主要是由于胰头肿大压迫胆总管所致，也可是胰性假性囊肿和纤维化肿块压迫胆管造成的。
9、腹水及胸水
少数患者伴有腹水，腹水量多少不一。蛋白含量常超过25g/L。炎细胞较少，腹水淀粉酶高于血液淀粉酶。长期CP且有严重营养不良的患者，也可因低蛋白血症而引起全身水肿和腹水。