主动脉瘤引起血管内侧压增高，故呈进行性膨大，若长期发展，最后终归破裂，瘤体越大，破裂的可能性越大。栓塞为另一并发症。据统计，若不作手术治疗，90%胸主动脉瘤在5年内死亡，3/4腹主动脉瘤在5年内死亡。
主动脉瘤主要的治疗方法是进行手术，而其手术的并发症主要有以下几种：
1、大出血是手术最危险的并发症，也是手术的主要死亡原因，因此选用进口人造血管或国产人造血管经白蛋白预凝，能有效防止人造血管的渗血。人造血管应尽量与主动脉口径匹配，避免吻合口漏。血管吻合采用连续缝合法。
2、神经系统并发症是动脉瘤手术的另一严重并发症，术中可采用低温保护神经系统。主动脉根部或累及弓部的手术应用低温体外循环，在需要停循环时可应 用右锁骨下动脉插管，选择性脑灌注;降主动脉手术可采用左心转流保护脊髓和肾脏，当病变范围较长，需要切除较长的主动脉，应将肋间血管吻合到人造血管上， 应用肾上腺皮质激素保护神经细胞，加强围手术期管理，术前控制血压纠正心衰，术中注意血压的控制，尤其是在阻断开放前，应注意血压和循环容量，同时纠正酸 中毒和电解质紊乱，防止开放后血压下降出现心脏骤停。
3、大多数腹主动脉瘤位于肾动脉水平以下，肾动脉以下的腹主动脉阻断发生脊髓缺血或肾功能衰竭的可能性较少，但有可能发生双下肢供血障碍，因此腹主动脉阻断时间需尽量缩短。2%～7%的腹主动脉瘤手术需在肾动脉水平以上、甚至腹腔动脉水平以上阻断。
4、动脉瘤手术暴露范围大、耗时长、手术创伤、低温和体外循环对机体免疫力有影响，故术后易发生感染，预防可能导致感染的各个环节，并注意合理使用抗生素，避免抗生素使用不当造成的二重感染。