骨质疏松症的病因较多，尚未完全明了，可能是多种因素综合作用的结果，也可能只是其中的一种原因所造成的，常见的有遗传、内分泌、营养、失用、年龄以及免疫等多种因素。
1、营养因素
钙、磷、蛋白质、微量元素如氟、镁、锌等、维生素C、维生素D等的缺乏与骨质疏松密切有关。其中尤以钙、磷两种元素缺乏为主要原因。
2、缺少活动
运动、日光照射、重力负荷因素与骨量多少、骨质疏松症的发生有密切关系。运动时，神经内分泌调节对骨骼提供充分的矿物营养，使全身和局部骨钙含量增加;运动还可以保持对骨骼一定的机械刺激，刺激成骨细胞的活性，增加骨的形成;运动锻炼还可使绝经期妇女的雌激素分泌轻度增加。
3、遗传因素
骨量的丢失也与遗传因素有关，因此，遗传因素也是骨质疏松症发生的一个重要原因。例如，身材矮小的人较身材高大的易发生骨质疏松症;即使生活条件、身体状态、环境因素相近、性别相同、年龄相近的两个人，其骨质疏松症的发生和程度也有差别。
4、内分泌
在内分泌中，含有雌性激素、甲状旁腺激素、降钙素、活性维生素D、甲状腺素、雄激素、皮质类固醇激素、生长激素等，而以前4种激素尤为重要，特别是性激素是起决定性作用的，尤其对妇女的影响更为明显，例卵巢摘除或过早闭经的女性，由于雌激素分泌减少或不分泌，易发生骨质疏松。
5、失用因素
因骨折或骨病而需长期固定的患者，因患病需长期卧床者，肌肉瘫痪者，可引起骨质疏松症。一般认为，机体长期处于静止状态时，肌肉活动减少，骨缺少肌肉刺激，结果骨母细胞减少，正常骨的代谢过程遭到破坏，破骨细胞相对活跃，造成骨骼中的钙溶出，尿中的钙排出增加，最终导致骨质疏松症。