沙眼衣原体感染是近年来才发现的性病。因此，在生活中提高人们对沙眼衣原体的认识，自觉地进行自我防护，才会降低整个社会的发病率。
(1)杜绝性乱无论是对沙眼衣原体感染，还是对其他性病，都是最主要的预防措施。生活作风严谨，不参与淫乱嫖娼，不涉足婚外性行为，才能从根本上防患于未然。
(2)要注意个人卫生：个人的洗浴用品、毛巾独自使用;不穿借别人的内衣、泳衣;外出期间不洗盆塘;尽量使(转载自中国健康网http://www.69jk.cn，请保留此标记。)用坐式马桶，上厕所前洗手。这些做法可以减少接触感染的机会。
(3)配偶患沙眼衣原体感染期间要禁止性生活。现代医学有许多药物可以治疗沙眼衣原体感染，而且用药方便，患者只需坚持治疗就会很快恢复健康。治疗应在夫妻之间同时进行，妇女患病可能没有明显症状，不要因为没有症状就拒绝治疗而成为隐性传染者。
(4)孕妇如果感染沙眼衣原体可以用红霉素治疗。治疗后复查，确认痊愈后才能从阴道分娩