卵巢早衰目前尚缺乏理想的治疗方法。此类患者多数因出现闭经症状或要求生育而就诊。在年轻妇女中，因低雌激素闭经者应行人工周期替代治疗。目的是消除绝经期症状，期望生育和改善性功能，雌激素治疗可使FSH受体增加，促使残留卵泡发育，同时可预防因雌激素缺乏而引起的代谢异常，如骨质疏松症、冠状动脉病变等。常用结合型雌激素1.25mg/d或补佳乐1-2mg/d，连服21-24天，在最后10天，同时服安宫黄体酮8-10mg/d。也可在月经期第5天和14天分别服尼尔雌醇2-4mg，第21～25天服妇炎宁片5mg/d，连服5天。此疗法用药次数少，口服方便，几乎无胃肠道不良反应，比较经济。对有卵泡并要求生育者，可试行诱导排卵治疗，虽然生育可能性小，但也有怀孕的例子。具体方法如下。
1 雌激素人工周期疗法
至少3个周期，促使萎缩的子宫发育，国内外文献报道均有妊娠者。
2 促性腺激素治疗
因为卵巢有少数残余卵泡，经大量绝经期促性腺激素(hMG)治疗可获妊娠，或以LH-RH脉冲方法治疗。
3 克罗米芬及雌激素联合治疗
前者50mg/d，共5天;后者1～2mg/d，共20天。
4 试管婴儿或配子输卵管移植技术的应用
赠送卵子技术为解决卵巢早衰者的生育问题开辟了新的途径。患者使用雌孕激素使子宫内膜呈分泌期改变，时间须与供卵者同步。供卵者行促排卵治疗，适时取出成熟卵子，分别在体外将患者丈夫精子与供卵者的卵子受精，然后将受孕卵适时移植到患者子宫腔内(也可行配子输卵管移植)，适当补充雌孕激素至妊娠20周左右停止。