手术切除一侧或全甲状腺后，应常规补充甲状腺素，使甲状腺功能尽量维持正常。对分化型甲状腺癌，长期补充甲状腺素，能抑制TSH的分泌，减少肿瘤复发的可能，明显改善患者的预后。因此随诊过程中应密切注意TSH的水平，最好维持在正常值之下，而其他指标在正常范围内。
甲状腺癌手术后，应定期复查以发现可能出现的肿瘤局部复发或转移，包括颈部、上纵隔淋巴结转移及远处转移，如肺、骨、脑等部位的转移。一般建议术后3个月、6个月、1年定期复查，1年后每半年复查一次。检查方法包括常规体检、甲状腺及颈部B超、CT、MRI、同位素检查、胸片等，如发现可疑结节，必要时行细胞学或病理学检查以明确性质。一些血清学检查有时也有帮助，如对分化型甲状腺癌行全甲状腺切除者，TG(甲状腺球蛋白)明显升高提示肿瘤复发可能;对髓样癌患者，血清降钙素水平如大幅度升高，也提示肿瘤复发或转移。
如果检查发现肿瘤出现局部复发或颈部、上纵隔淋巴结转移，多数患者仍可通过再次手术达到根治。对分化型甲状腺癌，如果出现肺转移，可以将残留甲状腺腺体全部切除，清除所有的转移淋巴结后，行131I同位素治疗，同样可以获得较好的疗效。对骨、脑等部位的远处转移者，有时可以先切除转移灶，再行同位素治疗。如不能手术切除，治疗同肺转移。特别需提醒的是：手术能切净的甲状腺分化型癌及髓样癌，术后不建议行放疗和化疗。
因为放疗化疗不能带来更高的治愈率和控制率，相反会带来更多的副作用和并发症。只有对手术大部切除仅残留少量肿瘤的患者，术后辅以放疗能提高控制率，改善预后。对甲状腺未分化癌患者，可能出现短期内肿瘤复发或转移，所以随诊的间隔时间应缩小，比如1个月1次。肿瘤一旦发现复发或转移，提示预后不佳，肿瘤往往生长迅速。大部分患者丧失再次手术机会，仅能对症处理或以放疗、化疗等进行控制，外科能做的工作可能仅是气管切开或气管造瘘解决通气，胃造瘘解决进食问题。
甲状腺切除及颈淋巴结清扫后，一些患者可能会出现手术相关的并发症，如喉返神经损伤造成声音嘶哑、进食呛咳，甲状旁腺损伤造成低钙血症，四肢面部麻木甚至抽搐，颈部神经损伤造成的相应功能障碍等。患者出院时并不能全部恢复正常，需要在随诊过程中加以观察、建议，辅助功能的恢复。