若发现肛门外生殖器出现类似尖锐湿疣的疣状物，应到正规医院请有经验的皮肤科或性病专科医生详细检查，必要时行病理活检等检查，明确诊断。尖锐湿疣治疗中需要注意以下问题。
1、复发：无论用何种方法治疗，均有一定的复发率，造成复发的原因，一是对处于亚临床感染的皮损未予治疗，一是机体免疫力相对低下。因此，积极处理亚临床感染的病损，对减少复发是有用的途径。
2、再感染：夫妻或性伴双方因坚持同时治疗的原则。否则，可造成乒乓球式的反复交叉多次感染。
男性尿道口尖锐湿疣较为困难，且易复发。以光动力学治疗效果好，复发少。女性尖锐湿疣患者，应注意检查宫颈上皮有否受到感染。由于HPV16及18型的慢性感染可导致宫颈上皮的非典型增生，乃至宫颈癌的发生，因此需对宫颈尖锐湿疣，包括亚临床感染的损害予以及时治疗。如果做宫颈HPV定量检测，数值过高者，也可考虑光动力疗法。
对已经基本治愈的患者，建议外用咪喹莫特、干扰素凝胶或者2.5% 5-氟脲嘧啶软膏等，可以降低复发率。切忌在诊断不清楚时，自行急于治疗(如外涂药液)。 因为一旦外涂药液，皮疹的性状发生了变化，会给医生的诊断带来困难。