肾结石常发生于中壮年，并且男性多于女性，患者的临床症状取决于结石的病因、成分、大小、数目、位置以及活动度等，轻度肾结石患者可没有症状，严重的患者则可发生无尿、肾功能衰竭、中毒性休克以及死亡。患者的常见症状主要有疼痛、血尿、梗阻和感染等。
疼痛
肾结石引起的疼痛可分为钝痛和绞痛，疼痛部位常见于腰部和腹部。有的疼痛可能仅表现为腰部酸胀不适，活动或劳动可促使疼痛发作或加重。肾结石绞痛呈严重刀割样痛，常突然发作，疼痛常放射至下腹部、腹股沟或股内侧，女性则放射至阴唇。
血尿
肾结石患者疼痛时，往往伴发肉眼血尿或镜下血尿，镜下血尿较多见。患者经体力活动后血尿可加重，尿中可排出沙石，特别在疼痛和血尿发作时，尿内混有沙粒或小结石。
梗阻和感染
梗阻和感染为肾结石患者常见并发症，梗阻可引起患者肾积水，出现上腹部或腰部肿块。双侧上尿路结石或肾结石完全梗阻时，可导致无尿、肾功能衰竭、中毒性休克以及死亡。
全身症状
肾结石患者临床上可有发热、畏寒、寒颤等全身症状。