积极治疗淋病，临床上，淋病双球菌很多时候都和非淋菌性尿道炎致病菌同时感染，而淋病加大了非淋菌性尿道炎的发病机会，故患淋病后要积极治疗，彻底治愈。淋病治愈后要化验检查是否患有非淋菌性尿道炎。
一、按时、按量治疗
因为非淋菌性尿道炎的治疗不同于淋病能做到短期足量治疗，而且服药次数多，持续时间长，患者容易因公因事而忘记服药，或者1~2天后基本消失而停服，影响疗效或复发。此时不要急于改换药物。
二、注意少见病原体
若为滴虫、霉菌或其他少见病，尤其是霉菌性尿道炎，不能一味加用素，否则对患者危害更大，应查清后对症治疗。
三、禁止滥用抗生素
非淋菌性尿道炎治疗时不应滥用抗生素，如绝大多数青霉素药物对衣原体、支原体均无效，一般不应使用。磺胺对衣原体有效而对支原体均无效，链霉素大观霉素对衣原体无效对支原体有效，庆大霉素、新霉素、多粘菌素对衣原体无效。