一、宫腔积脓
当病情发展，子宫内膜转化为干酪样组织或形成溃疡时，即可形成宫腔积脓，严重者可以引起宫腔感染。
二、月经异常
由于结核杆菌侵犯子宫内膜，导致子宫内膜不能正常剥落而引起月经异常。有的患者可发生月经量减少、间隔时间增长、甚至出现闭经;
三、不孕症
不孕，可以分为绝对性不孕和相对性不孕。通过治疗仍不受孕者，称为绝对性不孕症;经过治疗仍有受孕可能者，称为相对性不孕症。
子宫内膜结核当属相对性不孕症。子宫内膜结核是导致不孕的主要原因之一。本病原发灶大多是肺结核，其次是腹膜结核，血行播散，先侵入输卵管，再蔓延至子宫内膜，导致受精卵无法正常着床于子宫内膜。从而导致不孕症的发生。
由于结核菌对输卵管的破坏较严重，应用足够的抗结核药物后获得正常妊娠的机会也甚微。曾有人综合700O余例患者的妊娠率发现，化疗后获得正常妊娠者仅31例，占0.44%，输卵管妊娠125例，流产67例。