影响脑卒中后功能恢复后果的因素很多，以偏瘫为例，下列因素会对运动功能的恢复产生重要影响
1. 部位
内囊后肢影响最大，同样大小和同样性质的脑损害如果发生在内囊后肢，引发的偏瘫最难恢复;
2. 大小
脑损伤体积的大小表明神经系统破坏的程度，破坏程度大的后果就严重;
3. 性质
就引发偏瘫后运动功能恢复的困难程度来讲，梗死>出血>栓塞;
4. 医学处理的及时程度和正确与否
发病后及时的、正确的处理可以控制住病情的进一步加重，及时地、最大限度地保护好残存的脑组织，甚至可以挽救一部分已经受损的神经组织(如及时溶栓可以挽救一大批因缺血而可能濒临死亡的神经元)，而预防和控制并发症可以为康复处理创造极为良好的条件。反之，将会大大影响康复的同步进行。
5. 患者有严重的言语交流障碍
不能配合主动性康复训练，将会严重影响偏瘫的恢复。
6. 患者有严重的认知功能障碍
如重度痴呆或重度忽略，将会大大延迟运动功能的恢复。
7. 患者有严重的并发症
不得不进行复杂的临床治疗，如严重的吸入性肺炎、泌尿系统感染，下肢深静脉血栓，严重的心脏病，精神异常，严重的高血压，糖尿病等，康复训练根本不能进行。
8. 康复处理是否及时和准确
如果造成了严重的“废用综合症”，“误用综合症”或过用，偏瘫患者运动的恢复就会十分困难。
9. 患者的体力活动耐受能力
在强化康复训练时，康复医疗的有效性是有时间依赖性和剂量依赖性的。患者体力经受不了适当时间和适当剂量的康复训练，就不能期望运动功能能快速恢复
10. 肢体软瘫的时间
一般偏瘫患者肢体在2-4周后肌张力由很低而转为升高。长期患肢肌张力低下的患者，运动功能的恢复较差。