新生儿败血症的治疗方法有许多。新生儿败血症早期正盛邪实，治疗应以祛邪为主，病情进展，正气渐虚，治疔当以扶正祛邪，回阳固脱。
一、辨证治疗
1.正盛邪实
治法：清热解毒凉血。
方药：黄连解毒汤合犀角地黄汤加减。水牛角、生地、丹皮各9g，赤芍、黄芩、黄柏各6g，栀子、甘草各3g，黄连1.5g。黄疸重加茵陈、柴胡;抽搐加钩藤、石菖蒲;衄血、便血加白茅根、仙鹤草。
2.正不胜邪
治法：益气温阳祛邪。
方药：四逆汤加减。生地、败酱草各6g，人参、炙甘草各3g，附子2g，干姜1.5g。出血明显加阿胶珠、白芍;额出冷汗加黄芪。
二、专方验方
1.清宫粉
广郁金30g，生山栀30g，寒水石30g，黄芩30g，黄连3g，玳瑁30g，琥珀1.5g，朱砂1.5g，冰片9g。共研极细末，过筛为散。每服3g，每日2次。适用于本病见惊厥者。
2.火府丹
生地1Og，木通6g，黄芩1Og，甘草3g。水煎服，每日1剂，分2次服。适用于本病高热者。
3.银翘生脉散
银花6g，连翘6g，人参6g，陈皮3g，麦冬4g，五味子4g。水煎服，每日1剂，分3次服。适用于本病由肺炎引起者。
4.茵陈茅根汤
茵陈1Og，白茅根15g，茯苓6g，车前草6g，猪苓5g。水煎服，每日1剂，分3～4次服。适用于本病伴黄疸者。