细菌性阴道病治疗原则为选用抗厌氧菌药物，主要有甲硝唑、克林霉素。性伴侣不需常规治疗。有HIV感染的BV患者治疗与无HIV感染的BV治疗大体相同。
BV治疗是杀灭相关微生物，如加特纳菌、专性厌氧菌、人型支原体，重建和恢复产H2O2乳酸杆菌占优势的阴道菌丛。本病可经性交传染，也是性传播疾病之一，治疗原则为选用抗厌氧菌药物，主要有甲硝唑、克林霉素。性伴侣不需常规治疗。
一、细菌性阴道病治疗方法
1.阴道上药
使用医生配剂栓剂阴道上药，对细菌性阴道炎治疗有很好的疗效，于冲洗后纳入阴道，冲洗后阴道上药。
2.外用药膏
使用医生配剂软膏外涂，可以治疗因细菌感染引起的外阴炎，减轻外阴痒痛的症状。选用止痒效果良好，对患细菌性外阴炎，阴道炎外阴痒痛难耐者适合的药物进行细菌性阴道炎治疗。
3.口服用药
可以通过口服用药对双方进行细菌性阴道炎治疗，口服药同样可以抑制肠道细菌。
4.中草药治疗
细菌性阴道炎治疗要使用具有清热解毒，杀虫止痒作用的中药煎水，熏洗外阴，既可以减轻症状，又能抑制消灭念珠菌。由于熏洗后患者的外阴痒痛，灼热症状明显减轻，因此更适用于急性细菌性阴道炎的妇女，可以减轻患者痛苦。另外，将中草药制成散剂或栓剂，还可以进行阴道上药。
二、细菌性阴道病的治疗用药
1.甲硝唑(metronidazole，灭滴灵)500mg，口服，每日2次，共7天
或甲硝唑2g，单剂量1次口服;甲硝唑是BV治疗的首选药物，有较强抗厌氧菌的活性，抗加特纳菌的活性，而无抗乳酸杆菌的活性。随机调查研究，7日治疗方案治愈率达95%，2g单剂治疗方案治愈率达84%。不耐受口 服甲硝唑可改为阴道内用甲硝唑凝胶。阴道用甲硝唑栓剂500mg，每晚一次置入，共7天，治愈率71%一79%;或0.75%甲硝唑凝胶5g，每天2次置入，共7天，治愈率为87%～91%。服用甲硝唑不能饮用酒精饮料，以免产生戒硫样作用。妊娠头3个月禁用甲硝唑，因可能有致畸作用。口服替硝唑 (tinidazole)，疗效与甲硝唑类似，副反应较少。
2.氯洁霉素300mg，每日2次，共7天
治愈率为94%以上，本药具有 很好抗厌氧菌活性，中度抗加特纳菌和人型支原体活性，是甲硝唑的第一个有效替代药物。适用于孕妇，或对甲硝唑过敏或不耐受者，或甲硝唑治疗失败者。局部治疗可用2%氯洁霉素阴道霜5g，每晚睡前1次，共7天，或每天2次，共5天;治愈率为92%~94%。
3.氨苄青霉素(ampicillin)0.5g，口服，每日4次，共7天，约40%~50%有效
本药具有较好的杀灭BV相关微生物活性，但也有杀灭乳酸杆菌作用。
4.乳酸杆菌制剂：每个含108～109个菌落形成单位，1个置入阴道，每天2次
共6天，治愈率为52%。然而.亦有用乳酸凝胶(pH值3.8)或乳酸栓剂(pH值3.3)调整阴道pH值达到治疗目的的研究，表明无效。
5.有HIV感染的BV患者治疗与无HIV感染的BV治疗大体相同