性病性淋巴肉芽肿的治疗越早越好，初期病人用药后，全身性症状可迅速消失但局部淋巴结肿的愈合有限。晚期出现严重并发症后治疗困难，往往需行手术治疗。疗方法包括全身治疗和局部治疗。全身治疗主要是及时应用抗菌药。
一、西医治疗
常用的药有
1、强力霉素
每次0.1g，每天2次，连服21天。
2、四环素
500mg，每天4次，连服21-28天。四环素对急性期有效，可使中停止发展，或数周后痊愈。
3、红霉素
500mg，每天4次，连服14-21天。孕妇和儿童可选用红霉素。
4、复方新诺明
开始每日2次，每次2g，以后每次1g，连服3周。替代疗法为强力霉素。
5、磺胺噻唑
首剂4.0克，以后每6小时1.0克，连用3周。
晚期患者可采用横胺剂或抗生素与皮质激素(强的松)联合疗法，能减轻下腹痛，减少直肠分泌物和减轻纤维化。
局部治疗可外用高锰酸钾水清洗外阴，对未化脓者可帖10%鱼石脂软膏或用红霉素、磺胺类软膏。淋巴结软化有波动(脓肿)形成者可在损害上方穿刺吸引脓液，并在脓腔内注入磺胺溶液。切不可作切开术，因其不易愈合。对已化脓者，可穿刺抽脓，并注入抗生素，不可切开引流，以免瘘管形成，不利愈合。对溃疡较深者，可行外科疗法，切除坏死的淋巴结。对晚期出现阴道或直肠狭窄者，须定期作扩张术。直肠狭窄严重者需做直肠切除术。有包皮及阴囊橡皮肿者，亦可手术切除。局部病灶还可以用超声波、紫外线、红外线、x线等物理疗法。
二、中医治疗
中医理论认为，根据性病性淋巴肉芽肿的病程发展，可分为三个阶段进行治疗：初期为外生殖器出现皮肤损害，此时因不洁性行为感染湿毒邪气，湿毒之邪凝聚于下，腐熟肌肤;继之出现的腹股沟淋巴结肿大、化脓为病程的第二期——成脓期，毒火凝结，阻滞气血;腹股沟淋巴结破溃形成痿管是病程发展的第三期——溃脓期，此期的病理机制是热盛于内，肉腐成脓，日久导致气血耗伤。
(1)皮损初起期
症见外生殖器、肛周出现小丘疹、小疱疹，轻微瘙痒，无疼痛。或可伴有头痛、发热、无力等症状。舌红，苔薄黄，脉弦滑。
治疗原则
清热解毒祛湿。
处方(《性病自查自治》)：龙胆草10克 白茅根15克 生地10克 大青叶15克 车前子15克 丹皮12克 黄芩8克 六一散20克水煎服。
(2)成脓期
腹股沟间淋巴结红肿疼痛，相互连结成块，固定不动。肿大的淋巴结逐渐化脓变软，有波动感。或伴咽干口渴，小便色黄，大便干结等症状。舌红，苔黄，脉弦滑。
治疗原则
清热解毒，活血止痛，消肿排脓。
处方(《性病自查自治》)：穿山甲8克 天花粉10克 白芷8克 皂刺10克 赤芍10克乳香 8克 没药5克 双花30克 甘草8克 当归尾10克 蒲公英30克水煎服。
(3)溃脓期
腹股沟淋巴结破溃后形成瘘管，久不收口，脓液质稀。伴头晕乏力，低热，食欲不振等症。舌质淡，苔薄白，脉沉细。
治疗原则
益气扶正，托里排脓。
处方(《性病自查自治》)：黄芪20克 白术10克 当归15克 穿山甲10克 皂刺10克 白芷 8克 双花15克 甘草6克水煎服。