母婴传播是新生儿感染乙肝的重要原因，在孕期孕妇都有可能将乙肝病毒传染给胎儿，其中以下三个时期最易发生母婴传播。
1.产前传播
产前传播即宫内感染，是指乙肝病毒通过胎盘屏障在胎儿肝脏内定位和复制，引起胎儿宫内感染。乙肝病毒通过胎盘屏障的机制尚不清楚，推测可能是由于胎盘屏障受损或通透性改变引起母血渗漏造成，目前治疗方法一般为在孕期给孕妇注射乙肝免疫球蛋白等药物来预防产前传播。
2.产时感染
产时感染指胎儿通过产道时，如皮肤或黏膜招致产伤或溃破，含有乙肝病毒母亲的血液、羊水、阴道分泌物经过新生儿擦伤的皮肤或溃破的组织进入新生儿体内导致感染。目前有研究表明，行剖宫产生产的新生儿感染乙肝病毒的机率小于自然分娩者，因此有乙肝的产妇最好是选择剖宫产。
3.产后感染
产后感染是通过母乳喂养和其他生活上的密切接触而传播。如果产女患有乙肝，在后可通过哺乳使新生儿感染乙肝，这一点已经得到证实，有研究乳汁中含乙肝病毒标志物HBsAg、HBeAg、HBV-DNA是具有传染性的直接指标，不宜哺乳。