复发性生殖器疱疹全身症状及皮疹较轻，病程短，出疹前局部有轻度烧灼、针刺感或感觉异常。根据临床表现的不同，临床将生殖器疱疹分为原发性、复发性和亚临床型3型。(1)初次感染者为原发性;(2)原发性生殖器疱疹皮疹消退后1～4个月之内复发的称复发性生殖器疱疹;(3)无症状或皮疹不典型，仅在生殖器部位产生轻微细小皮肤裂隙、溃疡的称亚临床型生殖器疱疹，此型占生殖器疱疹发病数的50%～80%。近年来，生殖器疱疹的发病率逐年上升，在西方国家，生殖器疱疹是仅次于非淋菌性尿道炎和淋病而居第3位的性传播疾病。由于机体免疫力及药物对Ⅱ型单纯疱疹病毒难以“斩草除根”，该病极易复发，有学者把该病称为难治愈的性传播疾病。由Ⅱ型单纯疱疹病毒引起的生殖器疱疹与生殖器肿瘤如宫颈癌的发生密切相关，且可增加艾滋病的感染机会，新生儿可通过胎盘及产道感染，故应积极防治。
目前针对生殖器疱疹的治疗缺少特异性，尚不能从根本上解决其复发问题，治疗的目的是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程，减少病毒排放，防止并发症和继发感染。治疗生殖器疱疹的方法主要是抗病毒治疗，结合免疫疗法、局部用药有望提高疗效;中医药在防治生殖器疱疹方面也具有一定的优势。
(一)系统疗法1.抗病毒疗法无环鸟苷(又名阿昔洛韦)是公认的治疗生殖器疱疹的首选药物，该药可抑制疱疹病毒的DNA合成，而对宿主细胞的DNA合成影响较小，故该药不良反应少，长期应用未发现明显蓄积中毒作用。原发性生殖器疱疹者可口服无环鸟苷0.2g，每4小时1 次，每日5次，连服7～10日。亦可选用万乃洛韦0.3g口服，每日2次，或泛昔洛韦0.25g口服，每日3次，均连服7～10日。复发性生殖器疱疹的治疗可分为发作期治疗和每日抑制疗法。发作期疗法最好在前驱症状或皮损出现24小时内开始治疗，可选用阿昔洛韦、万乃洛韦、泛昔洛韦，连服5日，剂量同上。对发作期治疗无效，前驱症状严重的病例及每年复发6次以上伴精神症状者可试用每日抑制疗法(初次发病后1年内许多患者原发感染后的前几个月内复发较频繁，应避免应用每日抑制疗法)，可应用阿昔洛韦0.4g口服，每日2次，或万乃洛韦0.3g口服，每日1次或泛昔洛韦0.25g口服，每日2次，连续服用4个月到1年，1年以后停止治疗，给予观察。据报道应用每日抑制疗法，在治疗期间，可以使复发的次数减少75%以上，目前尚未发现以上药物长期使用的毒副作用，但应定期检查血象及肝肾功能。值得欣慰的是随着机体免疫力的提高，该病的复发次数会逐年减少，患者也就没有必要终生与抗病毒药物为伍了。原发感染症状严重或皮疹广泛者，可用阿昔洛韦5～10mg/kg体重静滴，每8小时1次，连用5～7天或直至临床症状消退;对阿昔洛韦等洛韦类药物耐药及免疫功能低下者可使用膦甲酸钠注射液0.3g，每日1次静滴，静滴时间不宜少于1小时30分钟，连用7～14天，嘱患者多饮水。使用该药应防止其肾毒性及低钾血症、低钙血症的发生，避免与其他肾毒性药物同时使用，孕妇和儿童不宜使用本品，65岁以上的老年患者慎用本品，哺乳期妇女使用本品期间应暂停哺乳。
2.免疫治疗已有许多资料证明生殖器疱疹的复发与免疫缺陷密切相关，应用提高患者免疫功能的药物，可减少生殖器疱疹的复发。临床上常选用以下免疫增强药物：卡介苗多糖核酸注射液0.5mg肌注，隔日1次，18支为1疗程，一般应用1～2个疗程;甘草酸二胺注射液0.15～0.2g加入10%葡萄糖250ml静滴，连用3周;注射用胸腺肽10mg肌注，隔日1次，1个月为1疗程，连用1～2个疗程。亦可应用甘露聚糖肽片10mg口服，每日3次，1个月为1疗程，连服2～3个月。目前尚不主张用干扰素治疗生殖器疱疹。
3.中药治疗生殖器疱疹属中医“阴疳”之范畴，其病因病机为交媾不洁，外感淫邪湿毒，下注阴部而发疱疹，反复发作者为湿热秽毒蕴于阴部，日久伤阴，正气亏耗，淫秽之邪缠绵难去，导致病情经久不愈。根据生殖器疱疹原发性与复发性不尽相同的病因病机，原发性生殖器疱疹采用清热利湿，燥湿解毒之法，方选龙胆泻肝汤加减;复发性生殖器疱疹采用益气养阴，清热利湿之法，药用黄芪30g、太子参15g、知母12g、黄柏12g、生地30g、大青叶30g、板蓝根30g、丝瓜络30g、土茯苓30g、萆15g、甘草3g，水煎服，每日1剂。
(二)局部治疗原则是保持局部清洁、干燥，防止继发感染。皮疹处可选用以下药物外涂：3%阿昔洛韦霜、1%喷昔洛韦乳膏、酞丁胺搽剂、重组人干扰素α-2b乳膏等，局部忌用皮质类固醇激素制剂，皮损糜烂有少许渗液者可配合0.1%利凡诺溶液湿敷。
妊娠期生殖器疱疹的处理对于孕妇生殖器疱疹的治疗目前存在许多争议，争议的焦点是洛韦类药物能否用于孕妇以及用后能否达到控制复发的目的等，医学界目前不主张用洛韦类药物治疗妊娠期生殖器疱疹。国外资料表明，患原发性生殖性疱疹的孕妇，因病毒排放时间长，宫颈常受累，损害面积大，体内无保护性抗体等因素，经产道分娩时，母婴传播发生率为20%～50%，故需剖宫产以防止母婴传播.。对于患复发性生殖性疱疹的孕妇，因病毒排放时间短，损害面积小，体内有保护性抗体等因素，经产道分娩时，母婴传播的概率为0%～8%，分娩时如无活动性生殖器疱疹，则无须剖宫产;临产时有活动性生殖性疱疹则须剖宫产;妊娠末期(后3个月)，虽有短时复发，但在分娩时无活动性损害仍可经阴道分娩。 要避免生殖器疱疹的发生，洁身自好，杜绝不洁性行为是最好的防治措施。生殖器疱疹患者发病期间应避免性生活;不发病期若与他人发生性关系，必须使用避孕套。女性复发性生殖器疱疹患者需定期作妇科检查，以除外宫颈癌。生殖器疱疹患者平时应注意休息，避免劳累，保持情绪稳定，戒烟酒及辛辣刺激食品，这些措施有助于减少生殖器疱疹的复发次数。一旦复发，患者应及时到正规医院的皮肤性病科就诊。