肾结石治疗的目的，不仅是解除病痛，保护肾脏功能，而且应尽可能找到并解除病因，防止结石复发。因此治疗肾结石应针对病因治疗，即根据各种结石成分选择药物。
肾结石的治疗
1.针对尿钙增多症：针对尿钙增多症肾结石患者应选择合适的药物以减少尿钙，如噻嗪类利尿药、口服无机磷酸盐、纤维素磷酸盐。
2.针对草酸盐：高草酸盐尿是反复发生肾结石的最重要危险因素，此类患者可口服维生素B，每天25毫克~250毫克;口服考来烯胺，每天3次，每次4克;口服氨基葡聚糖，每天400毫克，餐后2小时服用。
3.针对尿酸盐和尿酸：此类患者占全部肾结石患者的5%~10%，患者可口服别嘌醇，每天100毫克，分2次~3次服用，以减少尿酸的产生。还可给予碳酸氢钠每天40mmol～60mmol，1g=12mmol;肾功能正常患者可给枸橼酸钾。
4.针对感染结石，磷酸镁铵结石：此类患者宜选用抗菌药物治疗尿路感染，以达到消灭感染的目的。
5.针对胱氨酸结石：此类患者应每天饮水3升，若临睡前喝水，晚间起床排尿后喝水300毫升。可分次服用碳酸氢盐2mmol/kg或150mmol，以维持尿液持续碱性。