鉴别诊断
锥体外系疾病须注意与锥体系统疾病导致的运动功能障碍相鉴别后者主要临床特点以瘫痪(肌力减退)为主，一般不难鉴别。另外不同类型锥体外系疾病之间的鉴别更为重要。
实验室检查
血电解质、微量元素及生化检查，有助于运动障碍疾病诊断，如肝豆状核变性患者血清铜尿铜和血清铜蓝蛋白含量测定，具有重要诊断意义。
其它辅助检查
1.CT或MRI检查如肝豆状核变性患者可显示双侧豆状核区低密度灶或MRI显示信号异常。
2.正电子发射断层扫描(PET)或单光子发射断层扫描(SPECT)可显示纹状体DA转运载体(DAT)功能降低DA递质合成减少和D2型DA受体活性改变等，对帕金森病诊断颇有意义。
3.基因分析对确诊某些遗传性运动障碍疾病有重要意义。