前列腺液培养发现已知的尿路致病病原体是选择抗菌药物治疗的依据。若发现泌尿生殖道罕见的病原体或共生菌，则不能确定为致病病原体。
非细菌性前列腺炎患者若有细菌感染迹象，经一般疗法治疗无效，亦适宜采用抗菌药物治疗。
抗菌药物的选择需注意前列腺腺泡与微循环间存在由类脂膜构成的前列腺-血屏障，妨碍了水溶性抗生素通过，大大降低了治疗效果。一些细菌分泌糖蛋白基质，阻碍了抗生素与细菌接近。
当有前列腺结石存在时，结石可成为细菌的庇护体。上述诸因素构成了慢性细菌性前列腺炎治疗上的困难，需要较长的疗程，且容易复发。
过去常用的药物如复方磺胺甲恶唑(SMZ-TMP)抗菌谱广，但不能在前列腺内浓集，连续用药2个月疗效仍不满意。
目前多主张内服喹诺酮类药物如氧氟沙星(ofloxacin)或左旋氧氟沙星(levofloxacin)。若无效继续用8周。复发且菌种不变，改用预防剂量以减少急性发作，使症状减退。
长期应用抗生素若诱发严重副反应，如假膜性肠炎、腹泻，肠道耐药菌株滋长等。则需更换治疗方案。另一方案是先用四环素，若症状减轻，延长至28天，症状不减则改用喹诺酮类药物。
非细菌性前列腺炎是否适宜使用抗菌药物治疗，临床上仍有争论。有证据说明过去曾使用喹诺酮类药物的患者，前列腺液或前列腺按摩后尿培养有假阴性结果。
沙眼衣原体和支原体可引起前列腺炎，而普通培养不会有阳性结果。而且有前列腺症状的患者，使用一疗程抗生素治疗，大约40%患者能取得疗效。
因此，“无菌性”前列腺炎患者也适宜使用对细菌和支原体有效的药物，如喹诺酮类药物，SMZ-TMP或单用TMP，与四环素、喹诺酮类药物并用或间隔使用。
如果抗生素治疗无效，确认为无菌性前列腺炎者，则停用抗生素治疗。
使用广谱抗生素作前列腺内注射可即时提高前列腺内药物浓度，消灭细菌、缩短疗程。
有作者提出可能导致肉芽肿形成，Yamamoto等用阿米卡星和头孢唑林(cephazolin)加入1%利多卡因经直肠前作前列腺注射，经1～2次注射后，前列腺液培养转阴1年以上者占56%。
Baert等用庆大霉素和头孢唑林经会阴部作前列腺注射，初次注射后2～4个月若前列腺液仍有细菌生长，再注射1次，发现71%患者症状消失少达6个月，一些患者需多次注射以维持长期疗效。
患者取仰卧，屈膝、髋，外展腿体位，穿刺部位选择会阴部中线或稍偏侧，离肛门沿1cm，沿躯干纵轴方向穿刺，针尖通过会阴中央腱后抵抗力骤减，然后有进入前列腺的韧性感觉。
注药部位应为前列腺外周带，穿刺部位不宜靠前方，以免太近尿道，引起尿频及血尿，也不宜刺入太深，以免注入精囊引起血精。注射前宜告知患者若有上述情况属正常现象，1～2天内尿频、血尿到血精症状会自行消失，不留下后遗症。
注射宜选用7号针头，药物宜选用利多卡因或普鲁卡因稀释，注药前宜先抽吸若有血液回流，宜调整插入深度。前列腺内药物注射一般每周1次，药物在前列腺泡内保存时间长，注射后1周其浓度仍有抑菌作用。
宜在下次注射前晚才射精，以达到佳治疗效果。此种疗法对有明显内毒素症状的细菌性前列腺炎患者往往能获得明显效果，有时于第1次注射后第2天症状已明显减退。
用双球囊导尿管封闭前列腺部尿道，从尿道腔注入抗生素溶液反流入前列腺管，亦可达到治疗目的。
2、消炎、止痛药
非甾体抗炎药可改善症状，一般使用消炎痛内服或栓剂，中药使用消炎、清热、解毒、软坚药物亦收到一定效果。
别嘌醇能降低全身及前列腺液中的尿酸浓度，理论上它作为自由基清除剂，还可清除活性氧成分，减轻炎症，缓解疼痛。不失为可选用的辅助治疗方法。
3、物理治疗
前列腺按摩可排空前列腺管内浓缩的分泌物以及引流腺体梗阻区域的感染灶，因此对顽固病例可在使用抗生素的同时每3～7天做前列腺按摩。
多种物理因子被用作前列腺理疗，如微波、射频、超短波、中波和热水坐浴，对松弛前列腺、后尿道平滑肌及盆底肌肉，加强抗菌疗效和缓解疼痛症状有一定好处。
4、受体拮抗剂
前列腺痛、细菌性或非细菌性前列腺炎患者的前列腺、膀胱颈及尿道平滑肌张力都增加，排尿时后尿道内压增高致尿液反流入前列腺管，是引起前列腺痛、前列腺结石及细菌性前列腺炎的重要原因。
应用α受体拮抗剂有效地改善前列腺痛及排尿症状，对防止感染复发有重要意义。常用的药物有阿夫唑嗪、特拉唑嗪、坦洛新或竹林胺。α受体拮抗剂宜用较长疗程，使有足够时间调整平滑肌功能，巩固疗效。
5、手术治疗
外科治疗可用于反复发作的慢性细菌性前列腺炎。前列腺摘除能够达到治愈的目的，但是要慎用。
由于前列腺炎通常累及腺体的外周带，因此，前列腺电切术(TURP)难以达到治疗的目的TURP能够去除前列腺的结石和前列腺导管附近的细菌感染病灶，有益于降低外周带病灶的再感染。慢性细菌性前列腺炎可导致反复尿路感染及不育。
6、多喝水、多排尿
在日常生活中男性朋友预防前列腺炎可以多喝水、多排尿，因为喝水并及时排尿能避免浓度高的尿液对前列腺造成刺激，多喝水能稀释尿液的浓度，及时将尿液中的细菌排出。
日常生活中以茶为饮品除预防和改善泌尿系统炎症。像杜仲、虫草、枸杞子、虫椹草就有消炎灭菌，清利湿热，补肾益气，补气养血的作用。
7、规律的性生活
有规律的性生活能缓解前列腺疾病，规律的性生活能避免前列腺长期充血而诱发炎症感染。
8、良好的生活习惯
在平时男性需要学习放松，生活压力减缓能有效的避免前列腺炎的发生，每天以温水清洗生殖器官，避免外界细菌的入侵，饮食方面需要以清淡为主，少吃或不吃辛辣刺激性强的食物。
