戾气有以下要点：
* 物质性可服药治疗;
* 通过口鼻侵犯体内，而致病与否则决定于戾气的量、毒力及人体的抵抗力;
* 戾气的种类不同，所引起的疾病会不同，侵犯的脏器部位也不一;
* 人类的疫病和禽兽的瘟疫是由不同的戾气所致;
* 痘疹与疔疮等外科化脓感染也是戾气所引起的。
古代痘疹就是天花，是严重传染病，早在汉代葛洪的《肘后方》已有记载，但一直没有有效的防治方法。直到明代发明人痘接种法，为预防天花开辟有效途径， 为免疫学的早期成就，在世界医学史上占有重要地位。
人痘接种法开始应用的确实日期仍不能确定，但是晚在明朝年间(1567-1572)确实有文献记载其应用。
外伤科的新成就
这时期，外科及创伤科有新进展;医家们主张治疗外伤疾病应内、外兼顾。同时对癌症有了较清晰的认识，例如认为致癌原因是情绪低落或是嗜吃油煎、辛辣、烧焦食物等。外科手术方面如止痛、消毒及止血的技术也提高了。
陈实功的《外科正宗》较突出地表现当时的成就。
陈实功(1555-1636)，江苏南通人。他从青年时代就专门研究外科，经过四十多年不断实践，在外科理论和手术方面都有独到之处。于晚年1617年完成《外科正宗》。
《外科正宗》论及外科常见疾病一百多种，并选入了唐宋以来的许多有效方剂。他主张治疗外科疾病应该内服和手术并重，认为脓肿疾病应该尽早开刀，以免贻误病情。
书内记载他曾经成功做过断喉吻合术;并在茴香散局部麻醉下，用铜筋丝线圈套及摘除鼻息肉。书内还有早对颈部恶性肿瘤及乳癌的记录。
另一位同期外科医家，王肯堂(1549-1613)，撰写《疡医证治准绳》。对外科诊治有丰富的论述，主张骨伤科医生首要必须了解骨骼结构。书内有很多中医外科史上早期的记载，如气管吻合术，耳廓、唇、舌、外伤的整形术。
当时他已认识到肿瘤不能手术治疗。
梅毒性病
典型的梅毒病大约在15世纪或稍前从外国经广东传入中国。明代梅毒病泛滥，医家陈可成撰《霉疮秘录》是较早的梅毒专书。书内记载梅毒不同病期症状，提出了用丹砂、雄黄等含砷的药物治疗。
是世界医学史上早应用砷剂治疗梅毒的记录。此外还论及预防梅毒的方法。
针灸
明代针灸继续有所发展，公元1443年明政府特定专人仿照宋代的式样，另行铸造针灸铜人。这时期出现了不少针灸著作。反映此期成就者，有高武及杨断洲。
高武，字梅孤，浙江鄞县人。16世纪中期先后完成《针灸节要》及《针灸聚英》，前者主要摘录自《黄帝内经》及《难经》的理论编成，很适合初学者应用。
杨断洲(1522-1620)，对16世纪以前的针灸学文献进行辑录，并结合自己心得经验，于1601年完成《针灸大成》。书内论及经络、穴位、针灸手法及适应症等，还介绍了应用针灸与药物综合治疗之经验。是17至19世纪重要的有关文献。
