其五是合理用药。
不少药物是肠道的冤家对头，位列黑名单之首的是解热镇痛类药物，由于本身的刺激作用以及对前列腺素的抑制，而损伤肠道黏膜，甚至诱发胶原性结肠炎，如阿司匹林、保泰松、吲哚美辛、吡罗昔康、布罗芬、萘普生等。
紧随其后的当数抗生素。这类药物又可分为两类，一类导致肠道菌群失调而引起伪膜性肠炎，以广谱类抗生素为，如林可霉素、克林霉素、四环素、头孢菌素、阿莫西林、利福平等；另一类可诱发出血性结肠炎，以氨苄西林、双氯西林、红霉素、麦迪霉素等为代表，通过致敏反应引发肠黏膜出血。
此外，地塞米松等激素类药物，利血平、降压灵、胍乙定等降血压药物，甲苯磺丁脲等降血糖药，或者抑制蛋白质的合成，或者抑制细胞增殖与上皮修复，或者直接刺激黏膜而损伤肠道。故生病吃药要请医生处方，医生会根据你的病情选择疗效好而副作用小的药物，尽量趋利避害。自己去药店购药要主动接受医生的指导，不要仅凭药品说明书而擅自行事。
其六是借助于某些保健食品
如食用乳酸菌等有益菌，直接将其吃进去，是快速的改善肠道功能的办法。另外就是食用大豆低聚糖等营养肠道营养品。它们不会被消化系统分解吸收，也极少被其他细菌所利用，几乎能全身到达“岗位”——肠道，从而促进双歧杆菌生长。
